Imparò il mestiere della fotografia e lavorò in quella professione per breve tempo, e nel 1959 si iscrisse alla scuola per infermieri. In cerca di lavoro, andò a Zagabria, come disse lui stesso: "Cosa avrei visto e imparato".
Nonostante la maestra gli avesse detto alle elementari: "Francesco, vai in città, lì ti faranno pittore", è diventato comunque un paramedico. Dal 1963, Franjo Klopotan è diventato membro della Società croata degli artisti naif e lavora come pittore professionista. Espone alla mostra "Il mondo degli naif" a Zagabria e tiene la sua prima mostra personale nel 1964 nella Sala dei sindacati dell'Ospedale Rebro di Zagabria.
Il catalogo di quella mostra recitava: "Gli piace dipingere i contadini, è cresciuto in mezzo a loro. Gli piace anche dipingere il mondo ospedaliero perché ora ci vive ma porta nell'anima il suo villaggio». Alla prima mostra espone oli su tela, oli su vetro e disegni a china su vari supporti. A quel tempo, il disegno era uno dei modi espressivi predominanti, come negli anni successivi, e le sue caratteristiche grafiche si svilupparono ulteriormente in futuro. L'infermiere Franjo Klopotan fu classificato tra i più preziosi pittori naif dagli esperti d'arte, che predissero che avrebbe avuto una grande fama.
Nel 1965 si reca ad Amburgo dove lavora come restauratore presso il museo cittadino. Si diploma alla scuola di ritocco calcografico e lavora nelle riviste "Hor Zu" e "Quick". Pubblica articoli su varie riviste; ad esempio, nel 1968, il suo dipinto My Hamburg è stato pubblicato sulla copertina della rivista Spektar. Durante il suo soggiorno in Germania ottenne grande prestigio e fama internazionale, e le sue opere all'estero furono caratterizzate come surrealiste.
La ragione di ciò era il modo in cui lavorava, scegliendo motivi, presentando scene, creature quasi mitiche nei suoi dipinti, modellando la profondità spaziale per gradazioni di luce e ombra, ecc. Fu paragonato a Hyeronimus Bosch, considerato da molti un precursore di Surrealismo.
In progetti espositivi stranieri, Klopotan è menzionato come rappresentante dell'allora arte naif croata e del passaggio alla finzione e al surrealismo. Franjo Klopotan è tornato in Croazia nel 1970 e si è stabilito nel suo villaggio natale di Presečno. Dal 1978 è membro della Società Croata di Belle Arti e dell'Associazione degli Artisti Croati. Ha immortalato la sua regione di Presečno e Varaždin in molte opere, quasi simbolicamente - con la monumentalità del paesaggio. In essa vivono personaggi umani, che creano spazi di realtà pittorica delineati nella peculiarità dell'ingenuo.
I personaggi, anche se a volte piccoli rispetto allo scenario circostante, dominano ancora lo spazio, a volte varcando il confine di un mondo plasticamente concreto ed entrando nel regno della visione surreale. Nella singolare connessione emotiva che l'autore ha con la sua terra natale - Varaždin e i suoi dintorni, il mondo delle espressioni artistiche popolari (paesani, animali domestici, ambiente rurale, tacchini, cavalli, uccelli, fiori stilizzati e alberi) si plasma in un mondo di estetica artistica speciale.
Le opere di Klopotan sono ricche di protagonisti, ognuno dei quali racconta le proprie esperienze. L'interno e i paesaggi in cui vivono (siano ispirati dalle loro improvvise apparizioni nell'immaginazione o siano nel mondo reale che ci circonda così il pittore li colloca nei dipinti) crea l'aspetto di un mondo speciale, diverso o l'evocazione dei sogni.
Le sue immagini, una volta viste, obbligano a riosservare ma anche a riconoscere, affinché lo spettatore possa adottarle e tradurle nella sua memoria. Motivi trasformati della realtà o dell'immaginazione, dove nulla è irrilevante, raccontano con audacia la loro storia a ogni osservatore.
Come rappresentante croato dell'arte naif, con mescolanze di surreale e narrativa Bosch, Klopotan è stato un rappresentante della creatività artistica non solo nell'area di Varaždin ma anche in tutta la Croazia. Ha esposto in numerose mostre collettive e personali in patria e all'estero, promuovendo la propria patria e la pittura croata.
È una figura inevitabile nell'arte naif croata e le sue opere, che sono ancora in gallerie e musei europei e americani di fama mondiale, appartengono a una parte importante della storia dell'arte croata e dell'identità culturale croata. La storia della creazione artistica in questa zona della Croazia nel campo dell'arte naif non è completa senza il lavoro artistico di Franjo Klopotan, che fin dall'inizio è stato una grande scoperta per il pubblico sulla scena nazionale ed europea.
